„Archiwum istnień” to impresyjna opowieść o nieznanej dotychczas działalności antropologów nazistowskich z Sekcji Ras i Ludoznawstwa Instytutu Für Deutsche Ostarbeit działającego w Krakowie w czasie II wojny światowej, w miejsce zlikwidowanego Uniwersytetu Jagiellońskiego.

Kolorowe zdjęcia, formularze z pomiarami antropologicznymi, testy psychologiczne, włosy w kopertach, odbitki palców – wszystko po to, aby starannie wyselekcjonować, odzyskać potomków „idealnej rasy”, zamieszkujących teren Generalnego Gubernatorstwa.

Po ponad półwieczu ludzie wówczas zmuszeni do poddania się badaniom mogą spojrzeć na swoje wizerunki i inne materiały zgromadzone na ich temat. Zdjęcia, które były narzędziem hitlerowskiej pseudonauki stały się z biegiem czasu zbiorem pięknych portretów ludzkich, za którymi kryją się skomplikowane i dramatyczne losy. Istotnym składnikiem filmu jest również korespondencja badaczy oraz ich wnioski z badań. One budują portret psychologiczny nazistowskich antropologów i pokazują jakie były ich cele oraz stosunek do badanych ludzi.